要解决Google浏览器插件多窗口不能同时运行的问题，可以尝试以下方法：
1. 检查插件是否兼容。有些插件可能与Google Chrome不兼容，导致无法同时运行多个窗口。尝试卸载并重新安装该插件，或者寻找其他兼容的插件。
2. 检查插件设置。在Google Chrome中，点击菜单栏的“更多工具”>“扩展程序”，然后点击右上角的三个点图标，选择“开发者模式”。在开发者模式中，找到您正在使用的插件，点击其设置图标，查看是否有关于多窗口支持的选项。如果有，请确保启用了相应的选项。
3. 更新Chrome浏览器。确保您的Google Chrome浏览器是最新版本。访问Chrome浏览器的官方网站（https://chrome.google.com/），点击右上角的“三点”图标，选择“更新和安全”，然后按照提示进行更新。
4. 使用第三方浏览器。如果上述方法都无法解决问题，可以考虑使用其他浏览器，如Firefox、Edge等。这些浏览器通常具有更好的多窗口支持功能。